生物凈化安全柜是當今微生物實驗室之必需品，特別是那些對操作者需要采取保護措施的場合，如醫療，制藥，科研等進行細菌培養時提供既無細菌無塵又工組安全的環境。生物安全柜內的所有物品，包括設備，都應在工作完成之后進行表面去污處理并從柜內取出，因為殘留的培養介質可能會提供微生物的生長條件。生物凈化安全柜的操作注意事項：
1.為了避免物品和物品之間的交叉污染現象產生，在柜內擺放的物品應該盡量呈橫向一字擺開，避免回風過程中造成交叉污染。同時避免堵塞背部回風隔柵影響正常風路。
2.柜內盡量不要使用明火！因為在明火使用過程中產生的細小顆粒雜質將被帶入濾膜區域，這些高溫雜質會損傷濾膜。無法避免一定需要使用的時候，宜使用低火苗的本生燈。
3.為了避免影響正常的風路狀態，柜內操作時手應該盡量平緩移動。
4.柜內盡量避免震動儀器（例如離心機、旋渦振蕩器等）的使用，因為震動會使得積留在濾膜上的顆粒物質抖落，導致操作室內部潔凈度降低，同時如果在前操作面平衡失敗還會引起安全柜對操作者的污染。
